Pure and Applied Chemistry

Pure Appl. Chem., 2013, Vol. 85, No. 9, pp. 1759-1770

http://dx.doi.org/10.1351/PAC-CON-12-10-17

Published online 2013-05-07

Glycan synthesis, structure, and dynamics: A selection

References

• 1. H.-J. Gabius, S. André, J. Jiménez-Barbero, A. Romero, D. Solís. Trends Biochem. Sci. 36, 298 (2011). (http://dx.doi.org/10.1016/j.tibs.2011.01.005)
• 2. G. A. Rabinovich, Y. van Kooyk, B. A. Cobb. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1253, 1 (2012). (http://dx.doi.org/10.1111/j.1749-6632.2012.06492.x)
• 3. S. Sato, M. Quellet, C. St-Pierre, M. J. Trembley. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1253, 133 (2012). (http://dx.doi.org/10.1111/j.1749-6632.2012.06475.x)
• 4. H.-C. Siebert, S. André, S.-Y. Lu, M. Frank, H. Kaltner, J. A. van Kuik, E. Y. Korchagina, N. Bovin, E. Tajkhorshid, R. Kaptein, J. F. G. Vliegenthart, C.-W. von der Lieth, J. Jiménez-Barbero, J. Kopitz, H.-J. Gabius. Biochemistry 42, 14762 (2003). (http://dx.doi.org/10.1021/bi035477c)
• 5. M. Nagae, Y. Yamaguchi. Int. J. Mol. Sci. 13, 8398 (2012). (http://dx.doi.org/10.3390/ijms13078398)
• 6. M. Kuttel, Y. Mao, G. Widmalm, M. Lundborg. Proc. 7^th IEEE Int. Conf. eScience, 395 (2011). (http://dx.doi.org/10.1109/eScience.2011.61)
• 7. B. O. Petersen, M. Krah, J. Ø. Duus, K. K. Thomsen. Eur. J. Biochem. 267, 361 (2000). (http://dx.doi.org/10.1046/j.1432-1327.2000.01008.x)
• 8. M. Faijes, A. Planas. Carbohydr. Res. 342, 1581 (2007). (http://dx.doi.org/10.1016/j.carres.2007.06.015)
• 9. J.-L. Viladot, V. Moreau, A. Planas, H. Driguez. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1 2383 (1997). (http://dx.doi.org/10.1039/a701431g)
• 10. B. Cobucci-Ponzano, M. Moracci. Nat. Prod. Rep. 29, 697 (2012). (http://dx.doi.org/10.1039/c2np20032e)
• 11. M. Yokoyama. Carbohydr. Res. 327, 5 (2000). (http://dx.doi.org/10.1016/S0008-6215(99)00324-9)
• 12. L. F. Mackenzie, Q. Wang, R. A. J. Warren, S. G. Withers. J. Am. Chem. Soc. 120, 5583 (1998). (http://dx.doi.org/10.1021/ja980833d)
• 13. C. Malet, A. Planas. FEBS Lett. 440, 208 (1998). (http://dx.doi.org/10.1016/S0014-5793(98)01448-3)
• 14. V. Boyer, S. Fort, T. P. Frandsen, M. Schülein, S. Cottaz, H. Driguez. Chem.—Eur. J. 8, 1389 (2002). (http://dx.doi.org/10.1002/1521-3765(20020315)8:6<1389::AID-CHEM1389>3.0.CO;2-#)
• 15. R. Fauré, M. Saura-Valls, H. Brumer, A. Planas, S. Cottaz, H. Driguez. J. Org. Chem. 71, 5151 (2006). (http://dx.doi.org/10.1021/jo0525682)
• 16. J. Vasur, R. Kawai, E. Andersson, K. Igarashi, M. Sundgren, M. Samejima, J. Ståhlberg. FEBS J. 276, 3858 (2009). (http://dx.doi.org/10.1111/j.1742-4658.2009.07099.x)
• 17. J. Vasur, R. Kawai, K. H. M. Jonsson, G. Widmalm, Å. Engström, M. Frank, E. Andersson, H. Hansson, Z. Forsberg, K. Igarashi, M. Samejima, M. Sandgren, J. Ståhlberg. J. Am. Chem. Soc. 132, 1724 (2010). (http://dx.doi.org/10.1021/ja909129b)
• 18. J. Ståhlberg, J. Vasur, R. Kawai, K. H. M. Jonsson, G. Widmalm. Unpublished results.
• 19. O. Guvench, E. Hatcher, R. M. Venable, R. W. Pastor, A. D. MacKerell Jr. J. Chem. Theory Comput. 5, 2353 (2009). (http://dx.doi.org/10.1021/ct900242e)
• 20. G. Widmalm, R. W. Pastor. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 88, 1747 (1992). (http://dx.doi.org/10.1039/ft9928801747)
• 21. E. Säwén, T. Massad, C. Landersjö, P. Damberg, G. Widmalm. Org. Biomol. Chem. 8, 3684 (2010). (http://dx.doi.org/10.1039/c003958f)
• 22. B. J. Hardy, W. Egan, G. Widmalm. Int. J. Biol. Macromol. 17, 149 (1995). (http://dx.doi.org/10.1016/0141-8130(95)92681-F)
• 23. U. Olsson, A. S. Serianni, R. Stenutz. J. Phys. Chem. B 112, 4447 (2008). (http://dx.doi.org/10.1021/jp710977k)
• 24. M. Zaccheus, R. Pendrill, T. A. Jackson, A. Wang, F.-I. Auzanneau, G. Widmalm. Eur. J. Org. Chem. 4705 (2012). (http://dx.doi.org/10.1002/ejoc.201200569)
• 25. E. Säwén, B. Stevensson, J. Östervall, A. Maliniak, G. Widmalm. J. Phys. Chem. B 115, 7109 (2011). (http://dx.doi.org/10.1021/jp2017105)
• 26. P. Cagas, K. Kaluarachchi, C. A. Bush. J. Am. Chem. Soc. 113, 6815 (1991). (http://dx.doi.org/10.1021/ja00018a016)
• 27. S. Kornfeld, E. Li, I. Tabas. J. Biol. Chem. 253, 7771 (1978).
• 28. A. Varki, R. D. Cummings, J. D. Esko, H. H. Freeze, P. Stanley, J. D. Marth, C. R. Bertozzi, G. W. Hart, M. E. Etzler. Proteomics 9, 5398 (2009). (http://dx.doi.org/10.1002/pmic.200900708)
• 29. N. Noinaj, N. C. Easley, M. Oke, N. Mizuno, J. Gumbart, E. Boura, A. S. Steere, O. Zak, P. Aisen, E. Tajkhorshid, R. W. Evans, A. R. Gorringe, A. B. Mason, A. C. Steven, S. K. Buchanan. Nature 483, 53 (2012). (http://dx.doi.org/10.1038/nature10823)
• 30. B. R. Brooks, C. L. Brooks III, A. D. MacKerell Jr., L. Nilsson, R. J. Petrella, B. Roux, Y. Won, G. Archontis, C. Bartels, S. Boresch, A. Caflisch, L. Caves, Q. Cui, A. R. Dinner, M. Feig, S. Fischer, J. Gao, M. Hodoscek, W. Im, K. Kuczera, T. Lazaridis, J. Ma, V. Ovchinnikov, E. Paci, R. W. Pastor, C. B. Post, J. Z. Pu, M. Schaefer, B. Tidor, R. M. Venable, H. L. Woodcock, X. Wu, W. Yang, D. M. York, M. Karplus. J. Comput. Chem. 30, 1545 (2009). (http://dx.doi.org/10.1002/jcc.21287)
• 31. O. Guvench, S. S. Mallajosyula, E. P. Raman, E. Hatcher, K. Vanommeslaeghe, T. J. Foster, F. W. Jamison II, A. D. Mackerell Jr. J. Chem. Theory Comput. 7, 3162 (2011). (http://dx.doi.org/10.1021/ct200328p)
• 32. R. Eklund, G. Widmalm. Carbohydr. Res. 338, 393 (2003). (http://dx.doi.org/10.1016/S0008-6215(02)00503-7)
• 33. W. L. Jorgensen, J. Chandrasekhar, J. D. Madura, R. W. Impey, M. L. Klein. J. Chem. Phys. 79, 926 (1983). (http://dx.doi.org/10.1063/1.445869)
• 34. S. R. Durell, B. R. Brooks, A. Ben-Naim. J. Phys. Chem. 98, 2198 (1994). (http://dx.doi.org/10.1021/j100059a038)
• 35. J. W. Eaton, D. Bateman, S. Hauberg. GNU Octave Manual Version 3, Network Theory Ltd.