Pure and Applied Chemistry

Pure Appl. Chem., 2011, Vol. 83, No. 12, pp. 2199-2212

http://dx.doi.org/10.1351/PAC-CON-11-08-10

Published online 2011-10-29

Probing enzyme-mediated oxidation reactions in crystallo*

References

• 1. I. Schlichting. Acc. Chem. Res. 33, 532 (2000). (http://dx.doi.org/10.1021/ar9900459)
• 2. A. Heine, G. DeSantis, J. G. Luz, M. Mitchell, C. H. Wong, I. A. Wilson. Science 294, 369 (2001). (http://dx.doi.org/10.1126/science.1063601)
• 3. W. Kuhlbrandt. Nature 406, 569 (2000). (http://dx.doi.org/10.1038/35020654)
• 4. M. Yoshizawa, J. K. Klosterman, M. Fujita. Angew. Chem., Int. Ed. 48, 3418 (2009). (http://dx.doi.org/10.1002/anie.200805340)
• 5. P. Mal, B. Breiner, K. Rissanen, J. R. Nitschke. Science 324, 1697 (2009). (http://dx.doi.org/10.1126/science.1175313)
• 6. M. D. Pluth, R. G. Bergman, K. N. Raymond. Acc. Chem. Res. 42, 1650 (2009). (http://dx.doi.org/10.1021/ar900118t)
• 7. D. Bourgeois, M. Weik. Crystallogr. Rev. 15, 87 (2009). (http://dx.doi.org/10.1080/08893110802604868)
• 8. K. Moffat. Faraday Discuss. 122, 65 (2003). (http://dx.doi.org/10.1039/b201620f)
• 9. B. L. Stoddard. Pharmacol. Ther. 70, 215 (1996). (http://dx.doi.org/10.1016/0163-7258(96)00058-7)
• 10. I. Schlichting, J. Berendzen, K. Chu, A. M. Stock, S. A. Maves, D. E. Benson, R. M. Sweet, D. Ringe, G. A. Petsko, S. G. Sligar. Science 287, 1615 (2000). (http://dx.doi.org/10.1126/science.287.5458.1615)
• 11. E. G. Kovaleva, J. D. Lipscomb. Nat. Chem. Biol. 4, 186 (2008). (http://dx.doi.org/10.1038/nchembio.71)
• 12. G. D. Straganz, B. Nidetzky. ChemBioChem 7, 1536 (2006). (http://dx.doi.org/10.1002/cbic.200600152)
• 13. K. D. Koehntop, J. P. Emerson, L. Que Jr. J. Biol. Inorg. Chem. 10, 87 (2005). (http://dx.doi.org/10.1007/s00775-005-0624-x)
• 14. A. Karlsson, J. V. Parales, R. E. Parales, D. T. Gibson, H. Eklund, S. Ramaswamy. Science 299, 1039 (2003). (http://dx.doi.org/10.1126/science.1078020)
• 15. E. G. Kovaleva, J. D. Lipscomb. Science 316, 453 (2007). (http://dx.doi.org/10.1126/science.1134697)
• 16. N. I. Burzlaff, P. J. Rutledge, I. J. Clifton, C. M. Hensgens, M. Pickford, R. M. Adlington, P. L. Roach, J. E. Baldwin. Nature 401, 721 (1999). (http://dx.doi.org/10.1038/44400)
• 17. C. Yi, C. G. Yang, C. He. Acc. Chem. Res. 42, 530 (2009). (http://dx.doi.org/10.1021/ar800178j)
• 18. J. Ringvoll, L. M. Nordstrand, C. B. Vagbo, V. Talstad, K. Reite, P. A. Aas, K. H. Lauritzen, N. B. Liabakk, A. Bjork, R. W. Doughty, P. O. Falnes, H. E. Krokan, A. Klungland. EMBO J. 25, 2189 (2006). (http://dx.doi.org/10.1038/sj.emboj.7601109)
• 19. P. A. Aas, M. Otterlei, P. O. Falnes, C. B. Vagbo, F. Skorpen, M. Akbari, O. Sundheim, M. Bjoras, G. Slupphaug, E. Seeberg, H. E. Krokan. Nature 421, 859 (2003). (http://dx.doi.org/10.1038/nature01363)
• 20. T. M. Frayling, N. J. Timpson, M. N. Weedon, E. Zeggini, R. M. Freathy, C. M. Lindgren, J. R. Perry, K. S. Elliott, H. Lango, N. W. Rayner, B. Shields, L. W. Harries, J. C. Barrett, S. Ellard, C. J. Groves, B. Knight, A. M. Patch, A. R. Ness, S. Ebrahim, D. A. Lawlor, S. M. Ring, Y. Ben‑Shlomo, M. R. Jarvelin, U. Sovio, A. J. Bennett, D. Melzer, L. Ferrucci, R. J. Loos, I. Barroso, N. J. Wareham, F. Karpe, K. R. Owen, L. R. Cardon, M. Walker, G. A. Hitman, C. N. Palmer, A. S. Doney, A. D. Morris, G. D. Smith, A. T. Hattersley, M. I. McCarthy. Science 316, 889 (2007). (http://dx.doi.org/10.1126/science.1141634)
• 21. T. Gerken, C. A. Girard, Y. C. Tung, C. J. Webby, V. Saudek, K. S. Hewitson, G. S. Yeo, M. A. McDonough, S. Cunliffe, L. A. McNeill, J. Galvanovskis, P. Rorsman, P. Robins, X. Prieur, A. P. Coll, M. Ma, Z. Jovanovic, I. S. Farooqi, B. Sedgwick, I. Barroso, T. Lindahl, C. P. Ponting, F. M. Ashcroft, S. O’Rahilly, C. J. Schofield. Science 318, 1469 (2007). (http://dx.doi.org/10.1126/science.1151710)
• 22. R. J. Klose, Y. Zhang. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 8, 307 (2007). (http://dx.doi.org/10.1038/nrm2143)
• 23. Y. Mishina, L. X. Chen, C. He. J. Am. Chem. Soc. 126, 16930 (2004). (http://dx.doi.org/10.1021/ja045066z)
• 24. C. G. Yang, C. Yi, E. M. Duguid, C. T. Sullivan, X. Jian, P. A. Rice, C. He. Nature 452, 961 (2008). (http://dx.doi.org/10.1038/nature06889)
• 25. G. L. Verdine, D. P. Norman. Annu. Rev. Biochem. 72, 337 (2003). (http://dx.doi.org/10.1146/annurev.biochem.72.121801.161447)
• 26. B. Yu, W. C. Edstrom, J. Benach, Y. Hamuro, P. C. Weber, B. R. Gibney, J. F. Hunt. Nature 439, 879 (2006). (http://dx.doi.org/10.1038/nature04561)
• 27. Y. Mishina, C. He. J. Am. Chem. Soc. 125, 8730 (2003). (http://dx.doi.org/10.1021/ja034636c)
• 28. C. Yi, G. Jia, G. Hou, Q. Dai, W. Zhang, G. Zheng, X. Jian, C. G. Yang, Q. Cui, C. He. Nature 468, 330 (2010). (http://dx.doi.org/10.1038/nature09497)
• 29. P. O. Falnes, M. Bjoras, P. A. Aas, O. Sundheim, E. Seeberg. Nucleic Acids Res. 32, 3456 (2004). (http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkh655)
• 30. P. Koivisto, P. Robins, T. Lindahl, B. Sedgwick. J. Biol. Chem. 279, 40470 (2004). (http://dx.doi.org/10.1074/jbc.M407960200)
• 31. A. R. Pearson, R. L. Owen. Biochem. Soc. Trans. 37, 378 (2009). (http://dx.doi.org/10.1042/BST0370378)